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ファイルの種類圧縮配置ファイル
開発者 | EBI |
人気 | 3.0(1票) |
カテゴリー | データファイル |
フォーマット | バイナリX バイナリこのファイルはバイナリ形式で保存されます。そのためには、その内容を読み取るための特定のプログラムが必要です。 |
CRAMファイルとは何ですか?
European Molecular Biology LaboratoryのアウトステーションであるEBIによって開発された圧縮アライメントファイルフォーマット。 BWA、BBMap、BLATなどの短い読み取りアライナから生成された短いDNA配列読み取りアライメントを格納します。詳しくは
CRAMファイル形式はBAM(Binary Alignment / Map)ファイル形式に似ていますが、ファイル圧縮が改善され、列指向のバイナリコンテナ形式が再構成されています。遺伝的ソフトウェア分野でデータ量が増加するにつれて、CRAMフォーマットはアラインメントデータのディスク占有面積を減らすように設計された。
ショートリードアライメントは、配列がゲノムのどこから来たのかを解読するプロセスです。参照ゲノムはかなり大きく、参照ゲノムで完全に一致するものを常に探しているとは限らないため、これは困難になる可能性があります。ショートリードアライナは、一致および一致に近いものを探すために膨大な数のシーケンスを検索するために使用されます。シーケンスが非常に大きいので、ファイルサイズを管理しやすくするためには、CRAMのようなフォーマットによって提供される圧縮が必要です。
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CRAMファイルについて
私たちの目的は、*。cram拡張子が付いたファイルが何であるか、そしてそれを開く方法を理解するのを助けることです。
このページに記載されている圧縮アライメントファイルの種類、ファイル形式の説明、およびWindowsプログラムは、FileInfoチームによって個別に調査および検証されています。私達は100%の正確さを目指して努力し、そして私達がテストしそして検証したファイルフォーマットについての情報を公表するだけです。
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